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管轶新证据再次指向穿山甲!与新冠病毒氨基酸相似度达97.4%

2020-10-16 来源:lols10总决赛外围-英雄联盟s10外围网站
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    【lols10总决赛外围】新冠病毒潜在中间宿主的矛头早已不是第一次指向穿山甲了!2020年 2 月 7 日,华南农业大学针对新型冠状病毒肺炎疫情研究研制成功情况举办了新闻发布会。华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室教授沈永义、肖立华等科研人员会上回应,穿山甲有可能为新冠肺炎的潜在中间宿主。而近日顶尖病毒学家管轶领衔的研究,沦为穿山甲是中间宿主的又一力证——2020年 2月 18日,香港大学管轶团队与广西医科大学胡艳玲团队的取名为《中国南方马来亚穿山甲中 2019-Ncov 涉及冠状病毒的检验》(Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China)的论文在实印本网站 bioRxiv 上公开发表。

    【 图片来源:bioRxiv 所有者:bioRxiv 】三批穿山甲样本的分析与研究实质上,在所有哺乳动物中,穿山甲的非法走私次数是最少的。它们既被用于食物来源,也被用作中医药。

    在世界大自然维护联盟的濒临绝种物种红色名录上,许多穿山甲物种现在被确认为是极为濒临绝种的。因此,管轶团队从被走私的穿山甲中著手调查。

    具体来讲,研究团队对三批穿山甲样本展开了分析与研究(样本中还包括穿山甲“药材”)。首先,团队搜集了 2017 年 8 月-2018 年 1 月广西海关在反走私行动中搜出的 18 个冷藏穿山甲的(肺,肠,血液)等 43 个的组织样品。RNA 高通量测序表明,43个样本中有 6 个不存在冠状病毒:2 个在肺,2 个在肠,1 个是肺肠混合物中,1 个是血液中。

    据报,用于肠-肺混合样本,需要用于 Vero-E6 细胞系分离出一种新的乙型冠状病毒科。同时,利用序列读取数据,并通过用扩增子测序空缺缺口,团队在系统发育分析中取得了 6 个原始或相似原始的基因组序列——回应为 GX/P1E、GX/P2V、GX/P3B、GX/P4L、GX/P5E 和 GX/P5L——它们归属于 2019-Ncov 谱系(图 A)。

    这些病毒具备与 2019-Ncov 相近的基因组的组织,具备 9 个预测的对外开放读者板(图 B)。接着,研究团队对 2018 年 5-7 月间的一批穿山甲样品展开了更进一步 qPCR 检测,找到 12 只穿山甲的 19 个样本(9 个肠的组织,10 个肺的组织)中,3 个肺的组织样本呈圆形冠状病毒阳性。因此,两批穿山甲样本中的冠状病毒完全一致。

    最后,管轶团队联系了广州海关技术中心,中心新的检测了他们在 2019年 3月反走私行动中搜出的 5 个文档穿山甲样品(包括 2 个皮肤拭子,1 个未知的组织,1 个鳞片),这些样本中某种程度找到了冠状病毒。样本中的冠状病毒科新的冠病毒的两个亚型基于此,研究团队分解了占到全长病毒基因组 86.3% 的部分基因组序列,进而找到:在穿山甲样本中找到的冠状病毒基因组,与本次的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组相近率为 85.5%-92.4%,归属于此次新冠病毒的两个亚型,其中一个受体融合域(GD/P1L 和 GD/P2S)与新冠病毒密切相关。

    (公众号:)了解到,新型冠状病毒归属于 β 冠状病毒科的 Sarbecovirus 亚属,而早前 Sarbecovirus 亚属的冠状病毒成员经历了普遍的基因重组。管轶团队的更进一步分析结果显示,蝠冠状病毒 ZC45 和 ZCS21 包括多个 SARS-CoV 涉及谱系(基因组区域 2、5、7)和新冠病毒涉及谱系(还包括此次穿山甲中找到的病毒谱系)的基因组片段(区域 1、3、4、6、8)。而更加最重要的是,团队在穿山甲冠状病毒、蝙蝠冠状病毒 RaTG13 和新冠病毒之间仔细观察到了推断的重组信号,尤其是新的冠病毒与广东穿山甲冠状病毒的受体融合域的氨基酸序列相似性低约 97.4%。

    尽管新冠病毒在病毒基因组的其余部分与蝙蝠冠状病毒最涉及,但蝙蝠冠状病毒 RaTG 与其受体融合域的氨基酸相近度仅有 89.2%。同时,在分享氨基酸方面,广东穿山甲冠状病毒和新冠病毒在病毒受体区域的 5 个关键残基(如下图红框部分)上分享氨基酸,而蝙蝠冠状病毒只与新冠病毒分享一个氨基酸。

    另外,系统发育分析表明,广东穿山甲冠状病毒并非新冠病毒的最相似亲缘关系。因此,虽然当前无法得出清楚结论,但研究团队推断,广东穿山甲冠状病毒与新冠病毒之间的氨基酸相似性有可能是由于趋同演化,并非由重组引发,同时这也更进一步证明了中间动物宿主对人类病毒经常出现所起的起到(这也密码了此前的“人造病毒”阴谋论)。除蝙蝠外唯一被新冠病毒感染的哺乳动物了解到,穿山甲是截至目前除蝙蝠外唯一被新冠病毒感染的哺乳动物。而在穿山甲中找到了 2 个冠状病毒谱系,且冠状病毒谱系都与新冠病毒有关,大自然就指出穿山甲很有可能是新的冠病毒的长年宿主。

    但论文也提及了另一种可能性——穿山甲独立国家于蝙蝠或其他动物宿主,取得了新冠病毒涉及的病毒。而这个假设在相当大程度上也与穿山甲的来源有关——上述穿山甲样本大多来自东南亚,穿山甲所装载的病毒多样性可以说道是神秘莫测。实质上,正如研究团队所特别强调:冠状病毒,还包括与新冠病毒有关的病毒,在亚洲的许多野生哺乳动物中都显著不存在。

    因此,对于穿山甲传播病毒的流行病学、致病性、种间传染性和传播性等,还须要更进一步研究和调查。但不可否认的是,这项研究再度为新冠病毒中间宿主的研究认为了方向。关于管轶这篇论文的通讯作者之一乃是管轶。

    【 录:管轶及其团队,图源百度百科 】实质上,管轶是一名医学微生物学专家,英国皇家医学院外籍院士,香港大学于崇光基金教授席(病毒学)、新的放病毒性疾病学讲座教授,香港大学新的放传染性疾病国家重点实验室主任、香港大学流感研究中心主任,汕头大学·香港大学牵头病毒学研究所所长、粤港新的放传染病牵头实验室主任。2003 年,管轶团队首度分离出 SARS 病毒,并证实了果子狸是 SARS 的中间宿主,也是人类病毒感染 SARS 的必要来源,之后他和钟南山院士一起请示,广东开始清理市场上的果子狸,有效地遏止了 SARS 疫情。

    2017年,因“以防控人病毒感染 H7N9 禽流感为代表的新的放传染病预防体系长大创意和技术突破”,管轶与李兰娟院士、高福院士、袁国勇教授等人一起荣获年度国家科学技术变革特等奖。2020年这场侵袭的疫情开始之际(1 月 15 日),管轶拒绝接受专访时回应:冠状病毒最久潜伏期是 15 天,而自 1 月 3 日后,内地无追加传染病事例,可以辨别此次疫情早已获得掌控。

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    从目前看,病患症状不轻,即使有人传人,也十分受限。传染源确切了,疫情也掌控寄居了,我们早已可以看见胜利的曙光,坚信民众可以过个好年。不过,在 2020年 1 月 23 日,管轶拒绝接受财新网专访时又说道:激进估算,此次病毒感染规模最后可能会是 SARS 的 10 倍跳。

    我经历过这么多,从没深感惧怕过,大部分可掌控,但这次我害怕了。此言一出,批评管轶的声音铺天盖地——从抨击谴责,到人身攻击与辱骂。不过,管轶领衔的论文一出,或许也证明:这次我并没害怕。参考资料:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.13.945485v1.full.pdf原创文章,予以许可禁令刊登。

    下文闻刊登须知。。

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